Activités principales :

• Choisir, développer et adapter les protocoles de préparation et d’analyse des échantillons biologiques. Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques liées à la microbiologie, la biologie moléculaire et le séquençage haut débit.
• Mettre au point et optimiser les protocoles expérimentaux pour l’échantillonnage, la conservation, le traitement des échantillons biologiques
• Adapter, développer et optimiser les protocoles d’étude des acides nucléiques et en particulier des ARN (RT-PCR, RT-qPCR et métatranscriptomiques (RNA-seq)).
• Collecter, traiter, interpréter, exploiter et mettre en forme des données expérimentales tout en garantissant le suivi et la qualité
• Mettre en œuvre une ou plusieurs techniques expérimentales conduisant à l’obtention de connaissances sur la présence de gènes de virulence ainsi que sur leur expression dans des environnements (biotiques et abiotiques) contrastés
• Gérer et organiser les moyens techniques dans le cadre d’un projet scientifique : InovAQtion
• Conduire l’appareillage dédié (en particulier séquenceur Haut débit Illumina) en assurer le fonctionnement et la maintenance.
• Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité
• Assurer une veille scientifique et technique dans le domaine de la vibriose, des mécanismes de virulence, des études génomiques et transcriptomiques des Vibrions
• Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous formes de présentations orales et de publications