Laboratoire d'Océanologie et de Géosciences - Wimereux
Wiremeux
BIATSS
Contractuel - CDD
Catégorie A
Ingénieur de recherche
Biologie
BAC +5
12 Février 2024
Temps complet
26/01/2024
18 mois
2950
Rejoignez l’ULCO, l’Université à dimension humaine
Depuis 1991, l’Université du Littoral Côte d’Opale est un acteur majeur de l’enseignement supérieur et de la recherche dans les Hauts-de-France. Pluridisciplinaire et multipolaire, l’ULCO se caractérise par sa dimension humaine. Avec ses méthodes d’enseignement innovantes, une forte proximité avec les équipes, l’ULCO offre un cadre propice à l’acquisition des connaissances et au dialogue, pour un plein épanouissement de chacun.
En bref :
10 000 étudiants
4 campus (Boulogne-sur-Mer, Calais, Dunkerque et Saint-Omer)
1 000 personnels dont 500 enseignants
+ de 100 diplômes accrédités
3 pôles disciplinaires de recherche en prise avec les grands enjeux de notre époque et les problématiques des territoires
Le laboratoire d’océanologie et de géosciences (CNRS UMR 8187, Université du Littoral Côte d’Opale, Université de Lille, IRD) propose un poste d’ingénieur(e) de recherche de 18 mois dans le cadre du projet CPER-IDEAL. La mission principale sera la gestion du plateau séquençage de nouvelle génération. La personne recrutée travaillera en collaboration avec les partenaires scientifiques du projet CPER IDEAL. Elle devra développer et appliquer des méthodes de biologie moléculaire / séquençage de nouvelle génération, des expérimentations au laboratoire et analyser les résultats dans une démarche de qualité. Les travaux devront être valorisés sous forme de rapports, de publications et de communications scientifiques. Enfin, la personne recrutée assurera une veille bibliographique et participera au montage de projet pour la recherche de financement.
Activités principales :
• Développer des protocoles standardisés pour l’utilisation en routine des instruments de pointes mise en place au sein des plateformes technologiques, et en particulier de séquençage de Nouvelle Génération (NGS),
• Apporter un soutien technique et théorique sur les aspects de biologie moléculaire nécessaires à la bonne réalisation expérimentale des projets scientifiques,
• Conseiller et apporter des solutions techniques pour permettre de lever les verrous méthodologiques en analyses moléculaires,
• Analyser les échantillons (extraction d’acides nucléiques, clonage/séquençage, préparation de librairie d’ADN) dans le cadre des projets scientifiques, de suivi des écosystèmes et/ou de collaboration scientifiques,
• Mettre en place et utiliser des outils bioinformatiques pour analyser, interpréter et valider les résultats,
• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques via des publications, des protocoles et des rapports techniques,
• Former, en interne et en externe, aux technologies de pointes (biologie moléculaire, séquençage de nouvelle génération) et encadrer les utilisateurs,
• Assurer une veille scientifique pour faire évoluer les pratiques et les protocoles selon les dernières normes et développements technologiques,
• Participer à la rédaction/montage de dossiers dans le cadre des demandes de financement,
• Participer ponctuellement à des campagnes de terrain (prélèvements et mesures in situ..),
• Gérer le planning d’utilisation des appareils et veiller à l’application des règles d’hygiène et de sécurité.
CDD de 18 mois à temps plein à compter du 12 février 2024. Merci de transmettre CV et lettre de motivation à l’attention de M. Sébastien MONCHY : sebastien.monchy@univ-littoral.fr
Connaissance, savoir :
• Biologie moléculaire: connaissance des méthodologies de séquençage classique et à haut débit (préparation de librairie, métabarcoding, métagénomique…).
• Connaissance théorique et pratique des approches eDNA (notamment pour l’étude de la diversité des poissons)
• Développement de nouveau protocole d’extraction d’acides nucléique à partir d’une variété de matrice/organismes différents, être capable d’identifier différents marqueurs génétiques et d’en designer les primers
• Bioinformatique : connaissance appliquée dans l’analyse des données de séquençage à haut débit (métabarcoding, métatranscriptomique).
• Compétences en dissection d’organismes marins et extraction ADN de leurs microbiotes (moules, copépodes)
• Pratique courante de la Langue anglaise
Savoir-faire :
• Concevoir, adapter et mettre en œuvre les dispositifs expérimentaux adaptés aux contraintes de la recherche en biologie moléculaire
• Développer, par la veille et l’expérimentation, sa propre expertise scientifique et technologique dans son domaine
• Utiliser les logiciels bio-informatiques spécifiques à l’activité
• Rédiger des publications et rapport scientifiques s’appuyant sur la bibliographie, les matériels utilisés et les méthodes mises en œuvre
Savoir être :
• Capacité de raisonnement analytique
• Sens de l’organisation
• Sens relationnel
Merci de transmettre CV et lettre de motivation à l’attention de M. Sébastien MONCHY : sebastien.monchy@univ-littoral.fr