Caractérisation de la diversité et dynamique spatio-temporelle phytoplanctonique par le déploiement de techniques automatisées appliquées à haute résolution spatiale et temporelle dans les écosystèmes marins côtiers à partir de :

·         Initiation/utilisation de capteurs de fluorimétrie multispectrale, cytométrie en flux automatisée et acquisition/analyse d’images en flux à haut débit

·         Participation aux travaux et discussions dans le but d’améliorer leur interopérabilité et le contrôle qualité.

·         Participation à des inter comparaison et inter calibration de méthodes et techniques

·         Interfaçage avec les approches synoptiques de télédétection satellite

·         Exploration, test et application d’outils de traitement et classification automatisées.

·         Participation à la bancarisation des données issues des mesures automatisées

·         Traitement statistiques des séries temporelles et des données de campagnes océanographiques.

·         Calcul d’indices de diversité alpha, beta et gamma

·         Exploration des potentialités d’inclusion des mesures automatisées dans des modèles

·         Réaliser une veille bibliographique

·         Rapportage, publications scientifiques et présentations à des réunions de travail et colloques nationaux et internationaux.

La personne recrutée travaillera au sein de l’Equipe d’Ecologie Pélagique Planctonique (ECOP²) du LOG, au sein de l’Inssitut des Sciences de la Mer et du Littoral (ULCO) et de l’EUR IFSea. Le post-doctorat est financé par le Projet Prioritaire de Recherche (PPR) Océan et Climat « Observer et anticiper l’évolution des zones côtières françaises sous influence des fleuves au 21e siècle : RiOMar ». Ce projet a pour objectif de définir et de co-construire, avec les gestionnaires de l’environnement, une approche intégrée originale permettant leur gestion à moyen et long terme (20 à 100 ans), alliant des observatoires augmentés, des outils numériques innovants et des simulations numériques pour anticiper le devenir de la qualité des eaux côtières (production primaire, oxygénation, acidification, eutrophisation, contamination, algues toxiques/nuisibles) et du fonctionnement des écosystèmes marins du domaine côtier métropolitain sous influence des fleuves au cours du 21e siècle. Les observatoires augmentés visent à dépasser les réseaux d’observation existants au sein de l’Infrastructure de Recherche-ILICO en complétant, densifiant et en spatialisant les données à l’aide de capteurs innovants dont capteurs autonomes sur des plateformes fixes ou mobiles (navires de recherche et d’opportunité, gliders), synoptiques (satellites) ou de systèmes à bas coût (Mastodon-2D, micro-AUV).

Des collaborations seront effectives avec des chercheurs du LOG, SFR Campus de la Mer et ISML, des laboratoires du consortium du projet PPR RioMAR, ainsi que des partenaires d’autres projets, services et réseaux locaux et régionaux (CPER IDEAL), nationaux (IR ILICO et PPR FutureObs) et internationaux (OBAMA NEXT, DTO BioFlow) dans lequel le laboratoire est impliqué, autour de la thématique des observatoires intégrés et augmentés de la biodiversité marine des écosystèmes côtiers et marins.